动物基因组界的霸者

1.肺鱼

肺鱼是一种和腔棘鱼类相近的淡水鱼。肺鱼的鳔的构造很像肺，可以进行气体交换。对于绝大多数鱼类而言，鳔的作用主要在于帮助鱼上浮或下沉，增强平衡性，而呼吸则通过鳃来完成。而肺鱼的特别之处就在于，它不仅能通过鳃来呼吸，也能通过鳔来呼吸。这使得肺鱼可以在没有水的环境下，也能存活很长一段时间。这种鱼甚至比恐龙更古老，是现存的“活化石”。它们的基因组通常很大，其中斑纹肺鱼的基因组甚至高达130Gb。肺鱼分三个科，即非洲肺鱼科、美洲肺鱼科和澳洲肺鱼科。非洲肺鱼和南美肺鱼可生长在干旱季节很长的地方。旱季来临时，肺鱼会在土里挖个洞，呼吸空气，进入“休眠”状态。直到雨季的到来，它们会从洞里爬出，又恢复正常的生活方式。研究表明，有些肺鱼甚至能在这种休眠状态下生存长达5年之久。

澳洲肺鱼是现代肺鱼中最大的种类。体长可达125厘米，重达10千克。体呈长梭形，覆盖大而薄的圆鳞。澳洲肺鱼是肺鱼中唯一不能离水生存的，但其相对于其他鱼类，在流动缓慢的缺少氧气的水域也能正常存活。

2018年1月，Nature在线发表了基于PacBio测序和BioNano光学图谱测序组装的美西钝口螈基因组，该研究通过开发新算法MARVEL，实现了对大型基因组低深度三代测序组装，是迄今组装完成的最大的基因组。基因组信息显示，内含子和基因间区的极大扩张形成了美西钝口螈如此大规模的基因组。

利用新的长读长测序技术有望快速准确地解码这些古老动物的大型基因组，将为物种进化、断肢再生等研究提供基因组学基础。未来组携新的Oxford Nanopore、PacBio测序技术和BioNano光学图谱等，同时配备高水平生信分析团队，致力于为您提供高质量、高准确度的物种测序组装分析服务。

延伸阅读

参考文献

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