一体机结合三代、二代测序数据应用于农学科研以及医学科研项目等应用场景,适用于高校、研究所、医院等科研机构。
农学应用场景:基因组学,转录组学,表观组学。
部署希望组研发的Next系列软件NextDenovo+Nextpolish快速完成基因组Denovo组装,最快30分钟内完成400 Mb级别基因组Denovo组装。
整合三代、二代转录组(有参、无参)分析流程,自动化报告系统,用户可以根据自身需求自定义模块化分析流程。
部署三代甲基化分析流程,针对Nanopore和 Pacbio三代长读长实时测序技术,同时对甲基化具有高效、单碱基分辨率,无需额外样本制备的优势,可直接获得整个基因组范围内的区域甲基化信息。
医学应用场景:变异(SV/SNV)快速、准确检出;病原微生物快速检测。
变异(SV/SNV)快速、准确检出:
部署希望组私有云GrandBox实现对包括SV/SNV在内的变异快速检测,结合希望组本地数据dbsv 数据库以及NIST GIAB数据库对变异进行过滤。同时整合包括dbSNP、1k genome、OMIM等权威数据库。
病原微生物快速检测:
部署希望组自主研发病原微生物快速检测系统GrandPathogen,系统采用浏览器-服务器结构设计,提供用户图形界面,实现对包括新冠在内的多重病原微生物实时快速检测。