正式预售丨希望组引进多台PacBio大型测序平台Revio,大规模HiFi测序服务正式开启预售

2022年10月25日,PacBio宣布推出新一代Revio高通量HiFi测序平台,全新设计的SMRT测序芯片和高性能计算模块使Revio平台能够大幅提高通量并显著降低测序成本,同时利用HiFi测序技术的“既长又准”的优势,可以轻松实现大规模群体基因组项目的全类型变异检测。

Revio测序平台一经发布,希望组(GrandOmics)立即确定引进多台Revio测序系统,并将配套Revio测序系统进行生物技术和生信算法的工具研发,构建基于高通量Revio测序的完整生态系统,从而使客户能更容易得到全面的服务升级,让HiFi测序应用于科学研究和临床诊断没有障碍。

2022年11月18日,在希望组10年的三代测序技术开发和应用服务的经验积累基础上,正式面向全球提供基于Revio平台的HiFi测序预售服务。

首先,让我们来再次介绍Revio系统的基本情况:

Revio测序系统通量提升15倍,成本大幅下降

根据PacBio官方信息:Revio采用了全新的SMRT Cell芯片,该芯片上有2,500万个零模波导孔(ZMW),是现有芯片(800万个ZMW)的3倍。Revio能同时并行4张SMRT Cell,可同时提供多达1亿个ZMW进行单分子实时测序。结合计算模块的升级换代,Revio将提供更短的运行时间,并将单台设备HiFi测序通量提升15倍(图1)。

图1 Revio测序系统HiFi数据通量提升15倍(数据来自PacBio)

Revio采用最先进的NVIDIA GPU加速系统,与Sequel IIe相比,Revio的计算能力提高了20倍。GPU为碱基识别和HiFi读序生成提供了更加快速的响应时间,与Revio系统的测序通量保持同步。Revio还将与Google Health开发深度学习方法集成到测序仪中,以此提高HiFi的产量和测序准确性(图2)。

图2 Revio测序系统HiFi数据准确度提升(数据来自PacBio)

Revio能够提供每年以30X覆盖度多达1300个人类全基因组进行测序的能力,将基于HiFi的人类全基因组测序推进至1,000美元级别时代。凭借通量的提升和成本的下降,Revio将使HiFi测序能够支撑人类遗传学、癌症研究、农业基因组学等领域的大规模研究。

希望组基于PacBio Revio测序平台,结合自身技术储备正式提供以下服务内容:

1. 全基因组测序(HiFi-WGS)
基于PacBio Revio测序技术,可直接进行甲基化检测,并配合希望组自主研发的基因组结构变异自动化分析工具GrandSV+GrandSTR,可以很好的检测复杂的结构变异,全面解析甲基化+结构变异+单体型。Revio可提供每年多达1300个30X覆盖度的人类基因组测序能力。针对人类、动植物群体三代测序全基因组研究,即将成为全球新的热点!

2. T2T基因组组装(HiFi-T2T)
利用PacBio Revio测序,常规基因组组装已经可以达到非常高的质量,结合希望组开发的纳米孔BAC-long(150Kb)测序和Bionano光学图谱,再利用希望组开发的NextDenovo2组装软件及NextPolish2矫正软件,我们可以轻松实现大规模群体基因组T2T组装任务。

3. 泛基因组测序(Pangenome)
泛基因组运用高通量测序及生物信息分析手段,通过具有内在关联的不同亚种个体测序分析,并分别进行组装,不仅可以获得多个基因组信息,完善该物种的基因集,还可以获得个体特有的DNA序列和功能基因信息,有利于理解物种形成的分子进化机制及其与自然选择的关系。得益于PacBio Revio测序系统的高通量高准确度优势,解除了通量限制,开启泛基因组研究高精度时代!

4. 罕见病队列基因组研究
罕见病诊断与研究,一直是基因组医学的核心任务之一。尽管短读长测序技术已经革命性改善了罕见病诊断与研究,但是基因组变异的复杂性,还是给我们带来了很多困难,尤其是复杂结构变异、串联重复、单体型分型、甲基化分析等内容,需要不同的技术手段进行分析,费时费力。通过PacBio Revio平台,我们可以轻松实现一次性测序,全面变异检测,将极大的提高罕见病诊断与研究的水平。为此,希望组不仅开发了专门分析三代测序的GrandVariants软件系统,还开发了dbSV/dbSTR大规模三代测序全基因组数据库,可以极大提高三代测序罕见病诊断与研究的效率。

让我们借助最新技术的应用,给生命带来希望!

预售热线
电话:15387037487
邮箱:inquiry@grandomics.com

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