昆虫大军来袭你准备好了吗？
AGIS-CONFERENCE-昆虫基因组与绿色防控大会将于2018年4月21-23日在中国深圳召开。未来组将与您共享昆虫基因组学领域最新科研进展与前沿技术发展动态。
昆虫属于无脊椎动物中的节肢动物，是地球上数量最多的动物群体。昆虫分布面广，没有其他纲的动物可以与之相比，几乎遍及整个地球。世界上已记录的昆虫有100多万种（其中有害昆虫八万余种），是目前最大的未被充分利用的宝贵资源。
基因测序技术的发展使得对昆虫的研究进入了基因组学时代，为昆虫行为学和有害昆虫防控等领域的研究奠定了基因组学基础。而三代长读长测序技术（PacBio和Oxford Nanopore）的发展，为获得更完整更准确的昆虫全基因组信息提供了新方法。
未来组昆虫基因组项目经验
未来组萤火虫基因组组装案例—PacBio
2017年11月，未来组团队完成了首个萤火虫科物种的基因组测序组装，文章发表在GigaScience（首个萤火虫科物种的基因组测序组装——胸窗萤）。胸窗萤基因组基因组大小~785Mb，杂合度为2%-3%，其基因组中含有超过40%的重复序列 。
未来组通过高深度的PacBio测序，加上二代数据校正，以及去冗余过程，最终获得连续性、完整度和准确度都非常优异的高质量萤火虫参考基因组——组装基因组大小为760.4Mb，覆盖预估基因组大小的96.9%，contig N50为3.04Mb，经过BUSCO评估基因组完整性很好。
该研究获得的胸窗萤基因组是迄今为止除了模式动物果蝇之外，组装连续性最高的昆虫基因组。
未来组某昆虫组装案例—Nanopore
某昆虫基因组大小为~330Mb,Nanopore测序深度~100×，下机reads N50长达26.8kb，长读长是后续进行更准确的基因组组装的前提。该昆虫基因组组装Contig N50>7Mb；经Nanopolish + Pilon（×2）校正后，BUSCO评估能达到~98%，基因组组装完整性好。
未来组基于超长读长的Nanopore测序和搭配的超算平台，让基因组组装更连续，更快捷。
高质量的参考基因组是深入进行基因组研究的前提，未来组携最先进的Oxford Nanopore及PacBio Sequel测序仪，搭载超算集群，配合Bionano光学图谱和Hi-C染色体构象捕获技术，为昆虫基因组学的研究提供助力。
会议链接：http://reg.eventist.cn/home.html?eventid=811#content
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参考文献
Fu X, Li J, Tian Y, et al. Long-read sequence assembly of the fireflyPyrocoelia pectoralis genome[J]. GigaScience, 2017.
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