美国第三代测序仪制造商Pacific Biosciences公司高级产品经理Paul Kotturi 博士、亚太区现场应用经理Sian Loong Au及基因有限公司到访武汉未来组。

Pacific Biosciences公司和基因有限公司到访代表与未来组管理层以及生产、分析技术人员进行了学术交流及行业探讨，双方就最新的PacBio Sequel测序仪的发展与应用、三代测序技术的前景等方面交换了意见，并一致表示将在第三代测序领域进一步合作。

Pacific Biosciences公司是第三代基因测序系统开发和制造公司，主要设计、开发、制造及销售用于基因分析的单分子实时(SMRT)测序技术平台。2013年发布的 PacBio RS II系统已成为目前唯一大规模商业化运行的第三代测序平台；2015年又推出全新的Pacific Sequel 测序平台，通量更高、 体积更小，让测序成本显著降低，项目周期大大减少。

基因有限公司是Pacific Biosciences公司的中国区独家代理商，自2011年就开始将PacBio第三代单分子实时测序技术平台引入中国，目前已与未来组达成了长期战略合作。

武汉未来组已从Pacific Biosciences公司引进3台Sequel测序仪，部署在武汉光谷生物城的未来组生产研发中心，面积超过1000平方米，采用10万级洁净实验室，还搭建了天河Ⅱ号快速组装平台，为高度复杂的动植物基因组项目、人类基因组测序项目、复杂微生物组测序项目等提供最高的测序质量，最快的组装分析速度。

未来组不断升级技术平台，以满足呈指数增长的三代测序服务需求。未来组目前的测序分析服务涵盖了基因组学、转录组学、表观基因组学等多研究领域，为客户提供针对多组学研究相关领域的完整解决方案。

未来组Sequel已经就绪，我们正式揭开了它的神秘面纱：

Sequel测序仪是PacBio公司发布的最新的SMRT 测序仪器，与SMRT RSⅡ平台相比，具有很多优势:

通量更高，每个Cell有100万个ZWMs，通量提升了7倍;

体积更小，比想象的更mini，Sequel体积缩小到SMRT RSⅡ的三分之一；

成本更低，测序成本大大降低，配上最新版本的建库测序试剂，给广大科研学者们带来性价比更高的数据。

揭开庐山真面目

当然，仅仅是性能优越的仪器是无法满足高质量的基因组研究需求的，那么到底是什么能让我们在三代测序领域带来各种出色的三代产品呢？这里不只有Sequel，组学君带你来数一数这里的各种干货：

丰富的三代基因组组装经验

未来组自2011年成立以来，完成了涵盖微生物小基因组、动植物大基因组等各种大小300多个项目的纯三代基因组项目，积累了丰富的基因组组装经验。

优秀的三代信息分析团队

信息分析团队通过四年多来各种大小基因组项目的实战磨练，加上不断的创新积累，开发出了自己的组装流程，攻克各种大基因组（>10G）、多倍体基因组（四倍体、六倍体）组装等难题。

未来组具有全面的信息分析能力，覆盖了基于三代测序的各类大小基因组组装、基因组重测序、全长转录组、全基因组甲基化及富集甲基化、群体微生物研究等各种基因组学科研服务产品。对于这些产品，组学君将陆续为大家庖丁解牛。

武汉未来组今天正式宣布引进最新的美国三代测序平台Sequel，借助于独家开发的基于“天河二号”平台的三代测序基因组组装流程，未来组即将提供“一周一个动植物基因组”的特色服务。

2016年1月21日，三代测序服务公司武汉未来组与美国PacBio公司在中国的独家代理商基因公司顺利签约引进了Sequel测序仪。根据协议，未来组将引进至少3台最新的PacBio公司的三代测序平台Sequel，以满足呈指数增长的三代测序服务需求，从而继续领跑中国三代测序服务市场。这是未来组在采用“天河二号”超级计算机，顺利解决高度复杂动植物基因组组装问题之后，又一次进行技术平台的升级，以实现未来组构建中国有影响力的三代测序平台的战略目标。

本次引进的三代测序平台，包含3台Sequel测序仪及其附属配套仪器与软硬件，将部署在武汉光谷生物城的未来组生产研发中心，面积超过1000平方米，采用10万级洁净实验室，以确保生产过程中达到最高的环境标准，从而确保最高的测序质量。

与PacBio RS II平台相比，Sequel测序平台虽然体积只有约1/3，测序通量却提高了7倍。目前每台测序仪的通量超过8000Gb/年，相当于每年大约可以完成100个动植物基因组的测序(按1Gb估算)。目前，武汉未来组已经开始接受新测序平台的服务预定，在优先保证老客户使用的前提下，公司还将优先支持高度复杂的动植物基因组项目、人类基因组测序项目、复杂微生物组测序项目等领域。同时，该Sequel测序平台也将提供给兄弟公司北京希望组用于精准医疗方面的前瞻性科学研究，成为将三代测序用于医疗健康领域的机构。

关于第三代测序技术

第三代测序技术也称为单分子实时测序技术。美国Pacific Biosciences公司是目前正式商业化的第三代测序仪厂商，已在很大范围内为多个基因组学中心提供PacBio RS II测序仪，并于2015年10月推出新产品Sequel测序仪。PacBio测序具有超长读长(平均读长10-15Kb，最长读长可超过40Kb)、无PCR扩增偏差的单分子测序、直接分析碱基修饰等技术优势，已经快速应用于基因组de novo组装、转录组学研究等领域，随着性价比的不断提高，第三代测序技术将在未来的2-3年内快速普及。

1980年，噬菌体Φ-X174（5,368bp）完全测序，成为第一个测定的基因组，开启了基因组学时代。

1990年宣布开启2001年宣布完成的 “人类基因组计划”（1990-2001）推动着基因组学研究进入了21世纪。

之后的2005年，454公司推出了全球首台高通量测序平台Genome Sequencer 20 System，是继Sanger第一代测序之后的第二代测序技术。ABI紧随其后于2007年推出了其第二测序平台SOLID。

如今NGS测序市场一家独大的Illmina公司也在07年收购Solex，在Solex的GA平台的基础改进推出了大名鼎鼎的Hiseq系列平台，这一系列在之后的几年里也是屡添新丁，比如Hiseq2500、Hiseq3000、Next500/550、Miseq，还有如今炙手可热的Hiseq X10 & Hiseq 4000 ，这些新平台在测序读取长度、运行通量等方面较最初的Hiseq2000均有着较大的改善。

DNA测序技术在21世纪呈现出了快速更新模式，在这种模式的带动下，基因组学进入了一个高速发展的阶段，各个物种的基因组序列图谱也井喷式的出现在了各类数据库中，如图1所示。

图1 The Development Trend From NCBI

这些基因组的组装大多是基于传统的第二代测序平台，组装质量显得并不是那么令人满意，我们对NCBI收录的800多种动植物基因组图谱的ContigN50进行过一个统计，如图2所示，绝大部分的基因组组装ContigN50在200K以下。

Yandell 等人在12年Nature Reviews Genetics 的一篇研究中也指出了已发表基因组的 “外显子-内含子”注释中存在准确率不高的问题。