Oxford Nanopore官方计划在3月下旬在中国举办的首次Nanopore Day系列活动，未来组在此诚挚邀请您共同参加。

该系列活动由三场研讨会组成，跨越7天，分别在北京，上海和广州三地举办。每场研讨会为期一天，交流形式包括且不限于：

• 分享经验
• 介绍数据和网络
• 参与实际示范

现场除了Oxford Nanopore的员工会为您解答问题，未来组也将与您分享Nanopore组装经验、研发和应用进展。

在Nanopore Day北京会场（3月22日）与上海会场（3月26日），中国三代测序第一人–未来组&希望组CEO汪德鹏将与您分享我们基于Nanopore 技术在科研服务领域和医学应用方向的研究进展与展望。

关于Oxford Nanopore测序

原理简介

（a）motor蛋白牵引DNA至nanopore并解链

（b）DNA的单链通过纳米孔的时候，会对离子的流动造成阻碍。

（c）不同的碱基所造成电流大小的波动，就被记录下来。

应用

随着Nanopore技术的应用日渐成熟，通量和准确率得到极大提升，不断有研究者通过Nanopore数据进行从模式生物到更大基因组的组装，例如1 flowcell测拟南芥基因组^[1]；1 flowcell测果蝇基因组^[2]；~1Gb野生番茄基因组^[3]和~3Gb人类基因组^[4]等等。

近期Nanopore组装动植物基因组盘点

不得不提其中在Nature Biotechnology 上发表的Nanopore超长读长组装人类基因组的研究论文，通过低覆盖深度测序（~30×普通nanopore reads+ ~5× ultra-long reads）即能将基因组Contig N50组装到6.4Mb，填补了参考基因组（GRCh38）中12个gap，是来自单一测序手段得到的迄今最连续的人类的基因组。

Nature Biotechnology丨Nanopore测序组装人类基因组

Nanopore技术不仅通过ultra-long reads 在基因组组装方面有优异的表现，还有另外一个全新突破：Direct RNA测序[5]。不经反转、无须扩增的RNA直接测序能获得全长的链特异性RNA，无测序偏好性，并同时记录碱基修饰，为后续研究基因结构和基因表达，提供新技术新方法。论文也以封面文章形式于2018年2月发表于Nature methods。

Nature methods丨基于Nanopore的direct RNA测序方法测评

未来组自2017年9月开始逐步搭建Nanopore测序平台，于2018年1月17日通过Oxford Nanopore Technologies Limited（牛津纳米孔技术有限公司，ONT）官方认证，获得Nanopore DNA测序认证服务供应商资质。

未来组迄今已完成数十个Nanopore动植物基因组测序组装，“百个Nanopore基因组计划”正如火如荼地进行；后续会陆续购入通量更高的PromethION测序仪，并与牛津纳米孔公司携手推出“1000个中国人基因组结构变异检测计划”，共同开发在生命科学领域的应用。

参考文献

[1] MICHAEL,Todd P., et al. High contiguity Arabidopsis thaliana genome assembly with a single nanopore flow cell. Nature Communications, 2018, 9.1: 541.

[2] MILLER,Danny E., et al. High-quality genome assemblies of 15 Drosophila species generated using Nanopore sequencing.bioRxiv,2018, 267393.

[3] SCHMIDT,Maximilian H.-W., et al. De novo assembly of a new Solanum pennellii accession using nanopore sequencing. The Plant Cell, 2017, 29.10: 2336-2348.

[4] Jain M,Koren S, Miga KH, etal. Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads.Nature Biotechnology, 2018

[5] Garalde D R, Snell E A, Jachimowicz D, et al. Highly parallel direct RNA sequencing on an array of nanopores.Nature Methods,2018.

图片来源于网络｜侵删

2018年伊始，未来组与中国科学院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室达成长期学术交流合作协议，独家冠名赞助该国重2018年“遗传与进化交叉论坛”等一系列学术会议，共同推动中外动物基因组学信息流通，交流合作。

上周，“未来组”遗传与进化交叉论坛2018年第一场报告会在中国科学院昆明动物所西南多样性实验室报告厅成功举办。论坛有幸邀请到重点实验室学术委员会委员桂建芳院士及杨光教授做学术报告，为本论坛拉开帷幕。重点实验室学术委员会委员张克勤教授、昆明动物研究所姚永刚所长、赖仞副所长、重点实验室施鹏主任、毛炳宇副主任等PI以及研究所100余位师生聆听了报告并进行学术交流，论坛由重点实验室副主任焦保卫研究员主持。

报告前，焦保卫研究员简要介绍启动“未来组”遗传与进化交叉论坛的目的、分类等背景情况。桂建芳院士的报告以“从单性生殖银鲫雄性发生与决定机制的发现谈脊椎动物性别演化的多样性与可塑性”为题，完整的呈现了他20多年连续的研究成果。杨光教授以“适应进化驱动鲸类物种形成”为题，分析江豚物种形成时间，并评估其历史种群动态。

关于中国科学院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室

立足于我国西南和东南亚丰富的生物多样性遗传资源，面向战略生物资源的国家需求和世界科技前沿，在遗传资源多样性的演化与保护、基因与基因组的进化、遗传发育与进化三个重点研究方向上打下坚实的基础。

关于武汉未来组

拥有PacBio SMRT、Oxford Nanopore、BioNano光学图谱及Hi-C染色体构象捕获等技术和平台，长期致力于三代测序在基因组学方向的深度挖掘和应用，解决了动植物基因组、微生物基因组、全长转录组及微生物群体研究等领域的技术瓶颈，推动了基因组学研究的升级换代。

重点实验室与未来组的合作共同致力于突破技术研究瓶颈，推动科技的发展。本次合作是智慧与技术的结合、科技与成果的桥梁。未来组期待与更多伙伴进行多元化的深层次合作交流。

2018年1月13日-17日第26届国际动植物基因组学大会（Plant & Animal Genome Conference, PAG）在美国加州圣地亚哥Town & Country Hotel会议中心举行。欢迎莅临未来组展位424，共同探讨动植物基因组学新成果和进展。

高质量的参考基因组是深入进行物种起源进化和基因功能研究的前提，未来组精选本次会在PAG会议上呈现的基因组研究进展。

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