希望组ONT超长Q28实测数据首发!
过去的一周中, Oxford Nanopore London Calling顺利召开,会上分享了Oxford Nanopore 产品的最新情况,引入基于Transformer的大语言模型训练了新的basecaller – V5.0.0 SUP,实现了单链读取准确度大幅提升!
ONT官方数据展示
常规马达蛋白E8.2 + SUP basecalling 模型V4.2.0,ONT下机数据碱基质量峰值可达Q22(下文用Q20指代)。
官方升级更新后:新马达蛋白E8.2.1 + SUP basecalling 新模型V5.0.0,实现ONT下机数据碱基质量峰值达到Q28(下文用Q28指代)。
希望组实测数据首发展示
以Q7为过滤标准:Q28马达蛋白+不同basecalling模型比较
Q28马达蛋白+SUP basecalling V5.0.0模型,呈现最优碱基质量均值 & peak值,迈向ONT数据交付新高度
2.Q28马达蛋白+SUP V5.0.0模型,Q10 pass reads高达96%
哺乳动物示例:不同过滤标准+不同SUP basecalling模型比较
高质量 & 高产出
Q28马达蛋白+ SUP V5.0.0模型,以Q7为过滤标准,碱基质量均值25+,pass率高达98%
Q28马达蛋白+ SUP V5.0.0模型,以Q10为过滤标准, 碱基质量均值26+,pass率高达96%
即日起希望组承诺:
以Q10为过滤标准,Q28马达蛋白 + SUP V5.0.0
人血液质检合格样本 ONT Ultra-long N50 100K交付数据量不低于20G/Cell!
3. Q28马达蛋白+SUP V5.0.0模型,Q20 reads占比高达80%
Q28马达蛋白+SUP basecalling V5.0.0模型不同Q值过滤标准下数据占比
即日起希望组承诺:
以Q20为过滤标准,Q28马达蛋白 + SUP V5.0.0
人质检合格样本 ONT Ultra-long N50 100K交付数据量不低于15G/Cell!
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