产品介绍:
三代宏基因组病原微生物检测:mTGS(metagenomics third generation sequencing,mTGS)本产品利用三代测序平台(third generation sequencing,TGS)对疑似感染样本进行基于活病原快速检测,鉴定样本中存在的可疑致病微生物,包括细菌、真菌、病毒、耐药机制(基因和突变)等的检测。本产品提供快速、全面、准确的疑似致病微生物种属信息,通过报告协助临床医师进行分析判断,合理有效指导用药。
检测方法:
去除宿主核酸对病原进行富集,然后对富集的核酸进行Nanopore文库构建,上机Nanopore平台进行高通量测序,对样本中微生物进行实时测序并分析,通过与数据库中已有的病原微生物进行比对,从而对微生物种属进行鉴定以及耐药、毒力性分析。
检测流程:
样本采集、病原富集、核酸提取、文库构建、纳米孔测序、生物信息分析、报告解读等。
技术优势:
相比传统病原微生物检测方法,mTGS具有更高敏感性和特异性,可以明显提高阳性率检出。Nanopore测序仪更加小型便携,通过构建PCR-free 文库,实时测序在压缩测序时间同时提供检测时效性,长读长测序相比二代mNGS能够实现耐药、毒力更精确分型判断。
送样要求:
样本 | 体积 | 运输条件 |
痰液 | 3mL | 干冰密封 |
肺泡灌洗液 | 3mL | 干冰密封 |
脑脊液 | 2mL | 干冰密封 |
静脉血 | 3Ml | EDTA抗凝,冰袋运输 |
参考文献:
Wei, Gu, Steve,…. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection.[J]. Annual Review of Pathology, 2018.